Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb6Q922F4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms