Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms