Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6cQ91ZQ1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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