Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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