Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms