Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Smg8Q8VE18 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smg8Q8VE18 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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