Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc8Q8VD72 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms