Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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