Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms