Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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