Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms