Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms