Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Mtmr3Q8K296 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mtmr3Q8K296 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtmr3Q8K296 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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