Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms