Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms