Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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