Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrif1Q8CDD9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms