Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms