Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms