Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms