Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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