Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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