Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp54Q8BL06 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp54Q8BL06 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms