Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo28Q8BIG4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms