Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms