Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms