Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc29Q80VM3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms