Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp8Q80U87 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp8Q80U87 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms