Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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