Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clec18aQ7TSQ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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