Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tnfsf18Q7TS55 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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