Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms