Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sbno2Q7TNB8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sbno2Q7TNB8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms