Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms