Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms