Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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