Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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