Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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