Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms