Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top2bQ64511 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms