Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim24Q64127 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms