Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpd52Q62393 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpd52Q62393 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms