Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms