Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rbm38Q62176 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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