Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc2Q62029 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms