Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms