Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms