Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms