Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnot7Q60809 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cnot7Q60809 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot7Q60809 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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