Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms